del /f /s /q C:\*.tmp

Где
/f - удаляет все файлы, даже если у них установлен атрибут только чтение
/s - удаляет файлы из всех подкаталогов
/q - отключает запрос на подтверждение удаления файла
C: - диск, на котором будут найдены и удалены файлы. Можно указать не весь диск, а папку, например, C:\WinNT

*.tmp - тип файлов, которые будут удалены

Будьте аккуратны с ключем /q и типами удаляемых файлов. Команда удаляет, не спрашивая разрешения и при указании неправильного типа файлов может удалить лишнего.